Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LUMP51884 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LUMP51884 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LUMP51884 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LUMP51884 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LUMP51884 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LUMP51884 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LUMP51884 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LUMP51884 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LUMP51884 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LUMP51884 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LUMP51884 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LUMP51884 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LUMP51884 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LUMP51884 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LUMP51884 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LUMP51884 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LUMP51884 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LUMP51884 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LUMP51884 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LUMP51884 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LUMP51884 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LUMP51884 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LUMP51884 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LUMP51884 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LUMP51884 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LUMP51884 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LUMP51884 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LUMP51884 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LUMP51884 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LUMP51884 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LUMP51884 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LUMP51884 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LUMP51884 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LUMP51884 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LUMP51884 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LUMP51884 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LUMP51884 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LUMP51884 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LUMP51884 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LUMP51884 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LUMP51884 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LUMP51884 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LUMP51884 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LUMP51884 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LUMP51884 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LUMP51884 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LUMP51884 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LUMP51884 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LUMP51884 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LUMP51884 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LUMP51884 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LUMP51884 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LUMP51884 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LUMP51884 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LUMP51884 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LUMP51884 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LUMP51884 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LUMP51884 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LUMP51884 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LUMP51884 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LUMP51884 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LUMP51884 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LUMP51884 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LUMP51884 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LUMP51884 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LUMP51884 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LUMP51884 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LUMP51884 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LUMP51884 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LUMP51884 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LUMP51884 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LUMP51884 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LUMP51884 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LUMP51884 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LUMP51884 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LUMP51884 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LUMP51884 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LUMP51884 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LUMP51884 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LUMP51884 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LUMP51884 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LUMP51884 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LUMP51884 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LUMP51884 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LUMP51884 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LUMP51884 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LUMP51884 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LUMP51884 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LUMP51884 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LUMP51884 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LUMP51884 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LUMP51884 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LUMP51884 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LUMP51884 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LUMP51884 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LUMP51884 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LUMP51884 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms