Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCA2P51587 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms