Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERFP50548 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERFP50548 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERFP50548 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERFP50548 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERFP50548 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERFP50548 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERFP50548 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERFP50548 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERFP50548 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERFP50548 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERFP50548 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERFP50548 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERFP50548 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERFP50548 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERFP50548 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERFP50548 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERFP50548 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERFP50548 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERFP50548 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERFP50548 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERFP50548 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERFP50548 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERFP50548 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERFP50548 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERFP50548 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERFP50548 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERFP50548 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERFP50548 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERFP50548 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERFP50548 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERFP50548 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERFP50548 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERFP50548 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERFP50548 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERFP50548 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms