Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRIP1P50238 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP1P50238 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms