Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF4P48230 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM4SF4P48230 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms