Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC1A1P43005 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC1A1P43005 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC1A1P43005 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC1A1P43005 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC1A1P43005 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC1A1P43005 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC1A1P43005 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC1A1P43005 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC1A1P43005 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms