Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECI1P42126 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECI1P42126 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECI1P42126 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECI1P42126 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECI1P42126 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECI1P42126 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECI1P42126 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECI1P42126 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECI1P42126 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECI1P42126 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECI1P42126 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECI1P42126 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECI1P42126 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECI1P42126 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECI1P42126 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECI1P42126 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECI1P42126 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECI1P42126 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECI1P42126 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECI1P42126 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECI1P42126 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECI1P42126 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ECI1P42126 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ECI1P42126 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECI1P42126 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECI1P42126 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECI1P42126 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECI1P42126 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECI1P42126 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECI1P42126 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ECI1P42126 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECI1P42126 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECI1P42126 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ECI1P42126 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECI1P42126 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ECI1P42126 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECI1P42126 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECI1P42126 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECI1P42126 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECI1P42126 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECI1P42126 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECI1P42126 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ECI1P42126 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECI1P42126 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECI1P42126 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECI1P42126 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECI1P42126 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECI1P42126 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECI1P42126 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECI1P42126 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECI1P42126 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECI1P42126 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECI1P42126 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECI1P42126 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECI1P42126 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ECI1P42126 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms