Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL1P40616 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL1P40616 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL1P40616 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL1P40616 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL1P40616 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL1P40616 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL1P40616 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL1P40616 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL1P40616 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL1P40616 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL1P40616 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL1P40616 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL1P40616 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL1P40616 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL1P40616 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL1P40616 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL1P40616 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL1P40616 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL1P40616 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL1P40616 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL1P40616 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL1P40616 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL1P40616 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL1P40616 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL1P40616 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL1P40616 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL1P40616 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL1P40616 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL1P40616 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL1P40616 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL1P40616 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL1P40616 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL1P40616 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL1P40616 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL1P40616 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL1P40616 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL1P40616 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL1P40616 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARL1P40616 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARL1P40616 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARL1P40616 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARL1P40616 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARL1P40616 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARL1P40616 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARL1P40616 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms