Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS4P35443 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS4P35443 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS4P35443 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS4P35443 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS4P35443 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS4P35443 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS4P35443 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS4P35443 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS4P35443 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
THBS4P35443 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
THBS4P35443 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
THBS4P35443 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THBS4P35443 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THBS4P35443 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THBS4P35443 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THBS4P35443 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THBS4P35443 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THBS4P35443 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THBS4P35443 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
THBS4P35443 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THBS4P35443 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THBS4P35443 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
THBS4P35443 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THBS4P35443 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THBS4P35443 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THBS4P35443 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THBS4P35443 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THBS4P35443 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THBS4P35443 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
THBS4P35443 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms