Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDC27P30260 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDC27P30260 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC27P30260 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC27P30260 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC27P30260 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC27P30260 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC27P30260 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC27P30260 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC27P30260 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC27P30260 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC27P30260 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC27P30260 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC27P30260 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC27P30260 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC27P30260 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC27P30260 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC27P30260 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC27P30260 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC27P30260 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC27P30260 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC27P30260 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC27P30260 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC27P30260 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC27P30260 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC27P30260 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC27P30260 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC27P30260 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC27P30260 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC27P30260 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC27P30260 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC27P30260 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC27P30260 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC27P30260 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC27P30260 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC27P30260 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC27P30260 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC27P30260 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC27P30260 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC27P30260 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC27P30260 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC27P30260 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC27P30260 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC27P30260 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC27P30260 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC27P30260 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC27P30260 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC27P30260 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC27P30260 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC27P30260 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC27P30260 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC27P30260 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC27P30260 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC27P30260 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC27P30260 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC27P30260 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC27P30260 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC27P30260 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC27P30260 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC27P30260 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC27P30260 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC27P30260 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC27P30260 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC27P30260 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC27P30260 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC27P30260 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC27P30260 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC27P30260 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC27P30260 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC27P30260 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC27P30260 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC27P30260 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC27P30260 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC27P30260 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC27P30260 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC27P30260 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC27P30260 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC27P30260 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC27P30260 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC27P30260 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC27P30260 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC27P30260 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC27P30260 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC27P30260 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC27P30260 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC27P30260 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC27P30260 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC27P30260 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC27P30260 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC27P30260 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC27P30260 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC27P30260 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC27P30260 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC27P30260 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC27P30260 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC27P30260 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC27P30260 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC27P30260 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC27P30260 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC27P30260 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms