Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GADD45AP24522 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GADD45AP24522 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms