Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN2P17655 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms