Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2A2P16615 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2A2P16615 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms