Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFTRP13569 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CFTRP13569 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CFTRP13569 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CFTRP13569 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CFTRP13569 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CFTRP13569 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CFTRP13569 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CFTRP13569 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CFTRP13569 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
CFTRP13569 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFTRP13569 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFTRP13569 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFTRP13569 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFTRP13569 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFTRP13569 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFTRP13569 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFTRP13569 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CFTRP13569 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CFTRP13569 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CFTRP13569 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CFTRP13569 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CFTRP13569 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CFTRP13569 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CFTRP13569 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CFTRP13569 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CFTRP13569 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CFTRP13569 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CFTRP13569 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CFTRP13569 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CFTRP13569 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CFTRP13569 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CFTRP13569 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFTRP13569 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFTRP13569 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFTRP13569 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFTRP13569 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFTRP13569 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFTRP13569 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFTRP13569 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFTRP13569 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFTRP13569 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFTRP13569 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFTRP13569 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFTRP13569 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CFTRP13569 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CFTRP13569 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CFTRP13569 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CFTRP13569 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CFTRP13569 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CFTRP13569 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CFTRP13569 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CFTRP13569 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CFTRP13569 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CFTRP13569 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CFTRP13569 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CFTRP13569 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CFTRP13569 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CFTRP13569 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CFTRP13569 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CFTRP13569 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CFTRP13569 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CFTRP13569 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CFTRP13569 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CFTRP13569 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CFTRP13569 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CFTRP13569 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CFTRP13569 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CFTRP13569 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CFTRP13569 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CFTRP13569 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CFTRP13569 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CFTRP13569 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CFTRP13569 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CFTRP13569 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CFTRP13569 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CFTRP13569 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CFTRP13569 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CFTRP13569 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CFTRP13569 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CFTRP13569 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CFTRP13569 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CFTRP13569 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFTRP13569 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFTRP13569 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFTRP13569 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CFTRP13569 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFTRP13569 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFTRP13569 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFTRP13569 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFTRP13569 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFTRP13569 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFTRP13569 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFTRP13569 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFTRP13569 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CFTRP13569 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CFTRP13569 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CFTRP13569 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CFTRP13569 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CFTRP13569 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms