Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB7P09629 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
HOXB7P09629 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXB7P09629 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms