Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TNP1P09430 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TNP1P09430 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TNP1P09430 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms