Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms