Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C6orf47O95873 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C6orf47O95873 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms