Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP19O94966 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP19O94966 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP19O94966 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
USP19O94966 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
USP19O94966 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP19O94966 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP19O94966 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP19O94966 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP19O94966 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP19O94966 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP19O94966 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP19O94966 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP19O94966 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP19O94966 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP19O94966 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP19O94966 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP19O94966 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP19O94966 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP19O94966 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP19O94966 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP19O94966 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP19O94966 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP19O94966 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP19O94966 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP19O94966 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP19O94966 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP19O94966 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP19O94966 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP19O94966 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP19O94966 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP19O94966 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP19O94966 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP19O94966 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP19O94966 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP19O94966 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP19O94966 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP19O94966 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP19O94966 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP19O94966 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP19O94966 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP19O94966 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP19O94966 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP19O94966 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP19O94966 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP19O94966 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP19O94966 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP19O94966 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP19O94966 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP19O94966 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP19O94966 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP19O94966 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP19O94966 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP19O94966 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP19O94966 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP19O94966 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP19O94966 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
USP19O94966 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
USP19O94966 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP19O94966 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP19O94966 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP19O94966 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP19O94966 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP19O94966 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP19O94966 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP19O94966 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP19O94966 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP19O94966 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP19O94966 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP19O94966 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP19O94966 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP19O94966 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP19O94966 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP19O94966 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP19O94966 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP19O94966 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP19O94966 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP19O94966 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP19O94966 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP19O94966 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP19O94966 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP19O94966 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP19O94966 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP19O94966 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
USP19O94966 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
USP19O94966 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP19O94966 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP19O94966 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP19O94966 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP19O94966 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP19O94966 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP19O94966 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP19O94966 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP19O94966 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP19O94966 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP19O94966 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP19O94966 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP19O94966 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP19O94966 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP19O94966 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms