Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCP110O43303 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCP110O43303 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCP110O43303 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCP110O43303 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCP110O43303 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCP110O43303 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCP110O43303 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCP110O43303 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCP110O43303 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCP110O43303 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCP110O43303 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCP110O43303 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCP110O43303 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCP110O43303 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCP110O43303 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCP110O43303 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCP110O43303 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCP110O43303 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCP110O43303 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCP110O43303 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCP110O43303 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCP110O43303 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCP110O43303 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCP110O43303 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCP110O43303 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCP110O43303 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCP110O43303 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCP110O43303 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCP110O43303 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCP110O43303 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCP110O43303 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCP110O43303 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCP110O43303 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCP110O43303 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCP110O43303 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCP110O43303 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCP110O43303 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCP110O43303 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCP110O43303 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCP110O43303 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCP110O43303 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCP110O43303 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCP110O43303 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCP110O43303 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCP110O43303 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCP110O43303 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCP110O43303 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCP110O43303 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCP110O43303 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCP110O43303 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCP110O43303 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCP110O43303 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCP110O43303 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCP110O43303 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCP110O43303 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCP110O43303 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCP110O43303 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCP110O43303 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCP110O43303 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCP110O43303 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCP110O43303 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCP110O43303 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCP110O43303 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCP110O43303 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCP110O43303 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCP110O43303 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCP110O43303 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCP110O43303 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCP110O43303 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCP110O43303 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCP110O43303 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCP110O43303 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCP110O43303 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCP110O43303 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCP110O43303 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCP110O43303 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCP110O43303 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCP110O43303 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCP110O43303 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCP110O43303 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCP110O43303 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCP110O43303 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCP110O43303 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCP110O43303 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCP110O43303 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCP110O43303 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCP110O43303 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCP110O43303 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCP110O43303 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCP110O43303 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCP110O43303 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCP110O43303 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCP110O43303 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCP110O43303 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCP110O43303 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCP110O43303 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCP110O43303 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCP110O43303 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCP110O43303 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms