Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.188e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.278e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.288e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 TCF3-209ENST00000586410 288 ntTSL 512.76□□□□□ -0.378e-7■■■■□ 22
PRPF4O43172 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.223e-8■■■■□ 22
PRPF4O43172 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.893e-8■■■■□ 22
PRPF4O43172 NR5A1-201ENST00000373587 768 ntTSL 319.95■□□□□ 0.783e-8■■■■□ 22
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PRPF4O43172 LRRC75B-203ENST00000446942 1828 ntTSL 528.12■■■□□ 2.092e-9■■■■□ 22
PRPF4O43172 LRRC75B-202ENST00000404045 1417 ntTSL 326.74■■□□□ 1.872e-9■■■■□ 22
PRPF4O43172 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.762e-9■■■■□ 22
PRPF4O43172 LRRC75B-206ENST00000465334 957 ntTSL 225.97■■□□□ 1.752e-9■■■■□ 22
PRPF4O43172 LRRC75B-207ENST00000491910 2943 ntTSL 223.37■■□□□ 1.332e-9■■■■□ 22
PRPF4O43172 LRRC75B-205ENST00000464490 575 ntTSL 415.6■□□□□ 0.092e-9■■■■□ 22
PRPF4O43172 BRD2-215ENST00000580234 718 ntTSL 417.59■□□□□ 0.412e-6■■■■□ 22
PRPF4O43172 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.162e-8■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 GPR107-201ENST00000347136 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.522e-8■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 GPR107-203ENST00000372410 6991 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.552e-8■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 GPR107-202ENST00000372406 7353 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.572e-8■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 ATP13A3-205ENST00000457986 490 ntTSL 323.55■■□□□ 1.367e-8■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.787e-8■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 GSE1-214ENST00000574293 777 ntTSL 314.82□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.263e-8■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.458e-7■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 NPEPL1-207ENST00000529976 4684 ntTSL 1 (best)16.77■□□□□ 0.288e-7■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 NPEPL1-206ENST00000527587 4633 ntTSL 516.03■□□□□ 0.168e-7■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 GGNBP2-216ENST00000618837 2346 ntTSL 218.86■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.552e-6■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 GGNBP2-215ENST00000617860 3497 ntTSL 214.87□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 NDST1-207ENST00000523767 3449 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.357e-8■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.076e-7■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.36e-7■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 BICRA-202ENST00000594866 532 ntAPPRIS ALT2 TSL 221.21■□□□□ 0.999e-7■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.579e-7■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.359e-7■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 CIZ1-209ENST00000420484 684 ntTSL 328.25■■■□□ 2.111e-6■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.11e-6■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.081e-6■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.071e-6■■■■□ 21.9
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PRPF4O43172 CIZ1-218ENST00000476727 1205 ntTSL 516.84■□□□□ 0.291e-6■■■■□ 21.9
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PRPF4O43172 CIZ1-228ENST00000634901 3462 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 CIZ1-225ENST00000538431 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.451e-6■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 CIZ1-202ENST00000324544 809 ntTSL 310.33□□□□□ -0.761e-6■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.244e-6■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.661e-6■■■■□ 21.9
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PRPF4O43172 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.133e-6■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 AP2A2-212ENST00000528195 562 ntTSL 317.2■□□□□ 0.346e-7■■■■□ 21.9
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PRPF4O43172 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.26e-7■■■■□ 21.9
PRPF4O43172 HNF4A-207ENST00000609262 540 ntTSL 1 (best)16.8■□□□□ 0.281e-7■■■■□ 21.9
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PRPF4O43172 AURKAIP1-205ENST00000489799 695 ntTSL 1 (best)23.15■■□□□ 1.33e-6■■■■□ 21.8
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PRPF4O43172 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.363e-6■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 21.8
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PRPF4O43172 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.591e-6■■■■□ 21.8
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PRPF4O43172 HNRNPU-229ENST00000640440 871 ntTSL 313.69□□□□□ -0.224e-7■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 DOCK4-212ENST00000476846 3218 ntTSL 515.21■□□□□ 0.021e-6■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.131e-6■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.521e-6■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.521e-7■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 R3HDM2-208ENST00000448732 195 ntTSL 1 (best)22.12■■□□□ 1.138e-7■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.228e-7■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.148e-7■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.268e-7■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.13e-7■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 DHCR24-203ENST00000535035 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.633e-7■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.042e-7■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 EFNA1-201ENST00000368406 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.462e-7■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 ZNF581-202ENST00000585995 591 ntTSL 318.19■□□□□ 0.51e-6■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 CCDC106-208ENST00000592996 741 ntTSL 317.52■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 SSUH2-216ENST00000495366 2386 ntTSL 217.5■□□□□ 0.393e-9■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 ARL6IP4-218ENST00000540708 1782 ntTSL 225.22■■□□□ 1.631e-6■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 ARL6IP4-217ENST00000540382 1677 ntTSL 524.93■■□□□ 1.581e-6■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 ARL6IP4-214ENST00000536502 1273 ntTSL 220.18■□□□□ 0.821e-6■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.771e-6■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 ARL6IP4-215ENST00000539576 1684 ntTSL 519.78■□□□□ 0.761e-6■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 ZBTB1-205ENST00000556818 453 ntTSL 417.97■□□□□ 0.472e-8■■■■□ 21.8
PRPF4O43172 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.734e-7■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.494e-7■■■■□ 21.7
PRPF4O43172 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.584e-7■■■■□ 21.7
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