Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGPSO00116 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGPSO00116 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGPSO00116 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGPSO00116 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGPSO00116 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGPSO00116 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGPSO00116 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGPSO00116 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGPSO00116 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGPSO00116 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGPSO00116 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGPSO00116 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGPSO00116 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGPSO00116 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGPSO00116 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGPSO00116 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGPSO00116 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGPSO00116 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGPSO00116 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGPSO00116 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGPSO00116 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGPSO00116 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGPSO00116 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGPSO00116 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGPSO00116 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGPSO00116 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AGPSO00116 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGPSO00116 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGPSO00116 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGPSO00116 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGPSO00116 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGPSO00116 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGPSO00116 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGPSO00116 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGPSO00116 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGPSO00116 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGPSO00116 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGPSO00116 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGPSO00116 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGPSO00116 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGPSO00116 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGPSO00116 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGPSO00116 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGPSO00116 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGPSO00116 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGPSO00116 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGPSO00116 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AGPSO00116 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGPSO00116 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGPSO00116 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGPSO00116 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGPSO00116 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGPSO00116 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGPSO00116 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGPSO00116 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGPSO00116 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGPSO00116 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AGPSO00116 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGPSO00116 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGPSO00116 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGPSO00116 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGPSO00116 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGPSO00116 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGPSO00116 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGPSO00116 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGPSO00116 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGPSO00116 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGPSO00116 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGPSO00116 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGPSO00116 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGPSO00116 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGPSO00116 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGPSO00116 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGPSO00116 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGPSO00116 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGPSO00116 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGPSO00116 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGPSO00116 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGPSO00116 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGPSO00116 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms