Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9PBE3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9PBE3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9PBE3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9PBE3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
E9PBE3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9PBE3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9PBE3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E9PBE3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
E9PBE3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
E9PBE3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E9PBE3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
E9PBE3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9PBE3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9PBE3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9PBE3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9PBE3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9PBE3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9PBE3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9PBE3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9PBE3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9PBE3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9PBE3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9PBE3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9PBE3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9PBE3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9PBE3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9PBE3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9PBE3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9PBE3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E9PBE3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E9PBE3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E9PBE3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E9PBE3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E9PBE3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E9PBE3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E9PBE3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E9PBE3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E9PBE3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E9PBE3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E9PBE3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E9PBE3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E9PBE3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E9PBE3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E9PBE3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E9PBE3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E9PBE3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E9PBE3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E9PBE3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E9PBE3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E9PBE3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E9PBE3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E9PBE3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms