Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD1B0YJ81 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms