Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC160A6NGH7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms