Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ZNF316A6NFI3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF316A6NFI3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms