Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
XIRP2A4UGR9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms