Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms