Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.121e-323■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 CSNK2B-208ENST00000481269 785 ntTSL 211.92□□□□□ -0.52e-6■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 HSP90B1-209ENST00000552051 581 ntTSL 29.33□□□□□ -0.925e-10■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 HSP90B1-207ENST00000550595 694 ntTSL 28.78□□□□□ -15e-10■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.041e-7■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 ERCC6L2-206ENST00000466840 3586 ntTSL 1 (best)6.76□□□□□ -1.331e-7■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.62□□□□□ -1.991e-7■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-217ENST00000492572 1656 ntTSL 518.82■□□□□ 0.64e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-208ENST00000449494 622 ntTSL 516.19■□□□□ 0.184e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.14e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-210ENST00000458500 585 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.144e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.164e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-218ENST00000618723 2210 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.24e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-237ENST00000520415 620 ntTSL 313.4□□□□□ -0.264e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-215ENST00000489200 1519 ntTSL 213.29□□□□□ -0.284e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-204ENST00000424325 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.334e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-207ENST00000436473 657 ntTSL 212.68□□□□□ -0.384e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-214ENST00000485196 839 ntTSL 212.48□□□□□ -0.414e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-213ENST00000482732 1731 ntTSL 1 (best)11.99□□□□□ -0.494e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-216ENST00000491035 1369 ntTSL 511.55□□□□□ -0.564e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-201ENST00000344746 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)11.43□□□□□ -0.584e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-211ENST00000467168 802 ntTSL 211.39□□□□□ -0.594e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-209ENST00000451365 713 ntTSL 1 (best)11.32□□□□□ -0.64e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-205ENST00000427682 457 ntTSL 510.85□□□□□ -0.674e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-206ENST00000428169 292 ntTSL 510.38□□□□□ -0.754e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-229ENST00000518548 527 ntTSL 24.91□□□□□ -1.624e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.063e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.813e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.373e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.263e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.23e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.113e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.093e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.053e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.033e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.173e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME2-208ENST00000570801 565 ntTSL 213.73□□□□□ -0.213e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 AL713998.1-201ENST00000412872 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.54e-16■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME2-209ENST00000573262 789 ntTSL 1 (best)10.34□□□□□ -0.753e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 PGK1-201ENST00000373316 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.492e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 CROCCP2-201ENST00000362058 2029 ntTSL 226.08■■□□□ 1.776e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-215ENST00000523335 1540 ntTSL 218.89■□□□□ 0.616e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 SHMT2-225ENST00000556798 525 ntTSL 218.81■□□□□ 0.66e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-212ENST00000522407 541 ntTSL 417.44■□□□□ 0.386e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-213ENST00000522632 587 ntTSL 215.45■□□□□ 0.066e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-206ENST00000518584 566 ntTSL 214.97□□□□□ -0.016e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-203ENST00000517350 2150 ntTSL 1 (best)14.37□□□□□ -0.116e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 SHMT2-233ENST00000557529 1369 ntTSL 213.42□□□□□ -0.266e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 AFMID-205ENST00000586731 550 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.336e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 AFMID-210ENST00000589256 578 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.336e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-204ENST00000517756 445 ntTSL 512.41□□□□□ -0.426e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NUP214-222ENST00000530630 536 ntTSL 312.21□□□□□ -0.453e-8■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-210ENST00000521662 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.546e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-214ENST00000522766 567 ntTSL 411.68□□□□□ -0.546e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-207ENST00000519754 561 ntTSL 411.38□□□□□ -0.596e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 HNRNPUL1-209ENST00000595336 393 ntTSL 210.68□□□□□ -0.76e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-202ENST00000517311 2966 ntTSL 210.53□□□□□ -0.726e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-208ENST00000520147 857 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.746e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 RABGGTB-205ENST00000462042 569 ntTSL 39.98□□□□□ -0.816e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-201ENST00000339942 546 ntTSL 49.97□□□□□ -0.816e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-211ENST00000521688 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.826e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 WARS-242ENST00000557614 499 ntTSL 29.09□□□□□ -0.956e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 RABGGTB-209ENST00000473406 721 ntTSL 59.07□□□□□ -0.966e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 RABGGTB-204ENST00000461653 1702 ntTSL 58.71□□□□□ -1.026e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 RABGGTB-210ENST00000485459 788 ntTSL 58.49□□□□□ -1.056e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 RABGGTB-212ENST00000491266 961 ntTSL 38.22□□□□□ -1.096e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 RABGGTB-207ENST00000470201 848 ntTSL 37.69□□□□□ -1.186e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.256e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 RABGGTB-211ENST00000489450 586 ntTSL 55.93□□□□□ -1.466e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ARGLU1-201ENST00000360629 361 ntTSL 25.41□□□□□ -1.546e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 TRA2A-204ENST00000474586 868 ntTSL 322.49■■□□□ 1.195e-8■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.825e-8■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.665e-8■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.545e-8■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.535e-8■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 TRA2A-208ENST00000490942 862 ntTSL 1 (best)16.85■□□□□ 0.295e-8■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 TRA2A-203ENST00000448549 582 ntTSL 416.43■□□□□ 0.225e-8■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 TRA2A-209ENST00000494255 1653 ntTSL 1 (best)13.36□□□□□ -0.275e-8■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.512e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-207ENST00000595811 572 ntTSL 523.36■■□□□ 1.332e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-209ENST00000596837 682 ntTSL 223.21■■□□□ 1.312e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-203ENST00000594017 959 ntTSL 221.74■■□□□ 1.072e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-202ENST00000593570 813 ntTSL 521.7■■□□□ 1.062e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 12e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.992e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-204ENST00000594338 1853 ntTSL 520.88■□□□□ 0.932e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-208ENST00000596247 1563 ntTSL 219.91■□□□□ 0.782e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-201ENST00000221413 1478 ntTSL 1 (best)18.46■□□□□ 0.552e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 PI4KAP2-204ENST00000463608 2816 ntTSL 515.59■□□□□ 0.092e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.042e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.082e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 MCM4-202ENST00000517709 842 ntTSL 212.7□□□□□ -0.382e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 MCM4-205ENST00000518680 862 ntTSL 512.47□□□□□ -0.412e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 MCM4-208ENST00000519470 498 ntTSL 212.4□□□□□ -0.422e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RPL31-201ENST00000264258 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.62e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RPL31-203ENST00000409028 1110 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.672e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RPL31-210ENST00000441435 717 ntTSL 29.04□□□□□ -0.962e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.022e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RPL31-209ENST00000419276 781 ntTSL 57.87□□□□□ -1.152e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RPL31-211ENST00000456292 357 ntTSL 27.87□□□□□ -1.152e-6■□□□□ 10.8
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 2982 ms