Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.121e-323■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 CSNK2B-208ENST00000481269 785 ntTSL 211.92□□□□□ -0.52e-6■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 HSP90B1-209ENST00000552051 581 ntTSL 29.33□□□□□ -0.925e-10■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 HSP90B1-207ENST00000550595 694 ntTSL 28.78□□□□□ -15e-10■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.041e-7■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 ERCC6L2-206ENST00000466840 3586 ntTSL 1 (best)6.76□□□□□ -1.331e-7■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.62□□□□□ -1.991e-7■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-217ENST00000492572 1656 ntTSL 518.82■□□□□ 0.64e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-208ENST00000449494 622 ntTSL 516.19■□□□□ 0.184e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.14e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-210ENST00000458500 585 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.144e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.164e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-218ENST00000618723 2210 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.24e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-237ENST00000520415 620 ntTSL 313.4□□□□□ -0.264e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-215ENST00000489200 1519 ntTSL 213.29□□□□□ -0.284e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-204ENST00000424325 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.334e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-207ENST00000436473 657 ntTSL 212.68□□□□□ -0.384e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-214ENST00000485196 839 ntTSL 212.48□□□□□ -0.414e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-213ENST00000482732 1731 ntTSL 1 (best)11.99□□□□□ -0.494e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-216ENST00000491035 1369 ntTSL 511.55□□□□□ -0.564e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-201ENST00000344746 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)11.43□□□□□ -0.584e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-211ENST00000467168 802 ntTSL 211.39□□□□□ -0.594e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-209ENST00000451365 713 ntTSL 1 (best)11.32□□□□□ -0.64e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-205ENST00000427682 457 ntTSL 510.85□□□□□ -0.674e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 RPL10-206ENST00000428169 292 ntTSL 510.38□□□□□ -0.754e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-229ENST00000518548 527 ntTSL 24.91□□□□□ -1.624e-8■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.063e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.813e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.373e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.263e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.23e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.113e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.093e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.053e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.033e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.173e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME2-208ENST00000570801 565 ntTSL 213.73□□□□□ -0.213e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 AL713998.1-201ENST00000412872 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.54e-16■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NME2-209ENST00000573262 789 ntTSL 1 (best)10.34□□□□□ -0.753e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 PGK1-201ENST00000373316 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.492e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 CROCCP2-201ENST00000362058 2029 ntTSL 226.08■■□□□ 1.776e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-215ENST00000523335 1540 ntTSL 218.89■□□□□ 0.616e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 SHMT2-225ENST00000556798 525 ntTSL 218.81■□□□□ 0.66e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-212ENST00000522407 541 ntTSL 417.44■□□□□ 0.386e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-213ENST00000522632 587 ntTSL 215.45■□□□□ 0.066e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-206ENST00000518584 566 ntTSL 214.97□□□□□ -0.016e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-203ENST00000517350 2150 ntTSL 1 (best)14.37□□□□□ -0.116e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 SHMT2-233ENST00000557529 1369 ntTSL 213.42□□□□□ -0.266e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 AFMID-205ENST00000586731 550 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.336e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 AFMID-210ENST00000589256 578 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.336e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-204ENST00000517756 445 ntTSL 512.41□□□□□ -0.426e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 NUP214-222ENST00000530630 536 ntTSL 312.21□□□□□ -0.453e-8■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-210ENST00000521662 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.546e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-214ENST00000522766 567 ntTSL 411.68□□□□□ -0.546e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-207ENST00000519754 561 ntTSL 411.38□□□□□ -0.596e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 HNRNPUL1-209ENST00000595336 393 ntTSL 210.68□□□□□ -0.76e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-202ENST00000517311 2966 ntTSL 210.53□□□□□ -0.726e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-208ENST00000520147 857 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.746e-6■□□□□ 11
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UTP3Q9NQZ2 ENY2-201ENST00000339942 546 ntTSL 49.97□□□□□ -0.816e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ENY2-211ENST00000521688 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.826e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 WARS-242ENST00000557614 499 ntTSL 29.09□□□□□ -0.956e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 RABGGTB-209ENST00000473406 721 ntTSL 59.07□□□□□ -0.966e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 RABGGTB-204ENST00000461653 1702 ntTSL 58.71□□□□□ -1.026e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 RABGGTB-210ENST00000485459 788 ntTSL 58.49□□□□□ -1.056e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 RABGGTB-212ENST00000491266 961 ntTSL 38.22□□□□□ -1.096e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 RABGGTB-207ENST00000470201 848 ntTSL 37.69□□□□□ -1.186e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.256e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 RABGGTB-211ENST00000489450 586 ntTSL 55.93□□□□□ -1.466e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 ARGLU1-201ENST00000360629 361 ntTSL 25.41□□□□□ -1.546e-6■□□□□ 11
UTP3Q9NQZ2 TRA2A-204ENST00000474586 868 ntTSL 322.49■■□□□ 1.195e-8■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.825e-8■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.665e-8■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.545e-8■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.535e-8■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 TRA2A-208ENST00000490942 862 ntTSL 1 (best)16.85■□□□□ 0.295e-8■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 TRA2A-203ENST00000448549 582 ntTSL 416.43■□□□□ 0.225e-8■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 TRA2A-209ENST00000494255 1653 ntTSL 1 (best)13.36□□□□□ -0.275e-8■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.512e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-207ENST00000595811 572 ntTSL 523.36■■□□□ 1.332e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-209ENST00000596837 682 ntTSL 223.21■■□□□ 1.312e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-203ENST00000594017 959 ntTSL 221.74■■□□□ 1.072e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-202ENST00000593570 813 ntTSL 521.7■■□□□ 1.062e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 12e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.992e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-204ENST00000594338 1853 ntTSL 520.88■□□□□ 0.932e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-208ENST00000596247 1563 ntTSL 219.91■□□□□ 0.782e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RUVBL2-201ENST00000221413 1478 ntTSL 1 (best)18.46■□□□□ 0.552e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 PI4KAP2-204ENST00000463608 2816 ntTSL 515.59■□□□□ 0.092e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.042e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.082e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 MCM4-202ENST00000517709 842 ntTSL 212.7□□□□□ -0.382e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 MCM4-205ENST00000518680 862 ntTSL 512.47□□□□□ -0.412e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 MCM4-208ENST00000519470 498 ntTSL 212.4□□□□□ -0.422e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RPL31-201ENST00000264258 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.62e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RPL31-203ENST00000409028 1110 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.672e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RPL31-210ENST00000441435 717 ntTSL 29.04□□□□□ -0.962e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.022e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RPL31-209ENST00000419276 781 ntTSL 57.87□□□□□ -1.152e-6■□□□□ 10.8
UTP3Q9NQZ2 RPL31-211ENST00000456292 357 ntTSL 27.87□□□□□ -1.152e-6■□□□□ 10.8
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