Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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ARL2-SNX15V9GYD0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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