Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD54BQ9Y620 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms