Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMED7Q9Y3B3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED7Q9Y3B3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms