Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POMPQ9Y244 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POMPQ9Y244 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POMPQ9Y244 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POMPQ9Y244 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POMPQ9Y244 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POMPQ9Y244 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POMPQ9Y244 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POMPQ9Y244 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POMPQ9Y244 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms