Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMX5

NENF, Neudesin, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENFQ9UMX5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NENFQ9UMX5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms