Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB23Q9ULC3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB23Q9ULC3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms