Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

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Length 801 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRDM4Q9UKN5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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