Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHORDC1Q9UHD1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms