Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NKIRAS2Q9NYR9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NKIRAS2Q9NYR9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms