Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PSD3Q9NYI0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms