Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY99

SNTG2, Gamma-2-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG2Q9NY99 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNTG2Q9NY99 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTG2Q9NY99 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms