Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX43Q9NXZ2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms