Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM161AQ9NX61 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM161AQ9NX61 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms