Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms