Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ1

C8orf17, Protein MOST-1, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf17Q9NRJ1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C8orf17Q9NRJ1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms