Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC31■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC31■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DUOX2Q9NRD8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DUOX2Q9NRD8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms