Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC44

GPBP1L1, Vasculin-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1L1Q9HC44 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPBP1L1Q9HC44 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPBP1L1Q9HC44 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPBP1L1Q9HC44 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPBP1L1Q9HC44 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPBP1L1Q9HC44 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPBP1L1Q9HC44 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPBP1L1Q9HC44 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms