Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZYG11BQ9C0D3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZYG11BQ9C0D3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZYG11BQ9C0D3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZYG11BQ9C0D3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZYG11BQ9C0D3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZYG11BQ9C0D3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZYG11BQ9C0D3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms