Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BCO2Q9BYV7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms