Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms