Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CCDC106Q9BWC9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms